Η Δημοτική Ενότητα Εγνατίας αποτελείται από:
- την Τοπική Κοινότητα Μεγάλης Γότιστας
- την Τοπική Κοινότητα Μεγάλου Περιστερίου
- την Τοπική Κοινότητα Μικρής Γότιστας
- την Τοπική Κοινότητα Μικρού Περιστερίου (έδρα πρώην Καποδιστριακού Δήμου Εγνατίας)
- την Τοπική Κοινότητα Χρυσοβίτσας
- την Τοπική Κοινότητα Σίτσαινων
